神山寺建于唐大历年间，清乾隆十九年(公元1754年)重修。现存大殿一座，前进楼房一幢，后殿解放后烧毁。五代末期，赵匡胤破滁州曾率兵抵全椒境，经过此寺，安营神山。后周皇帝柴世宗(柴荣)冀图统一中国，于即位之当年，首先对南唐(都金陵，今南京)用兵，次年，柴世宗也曾亲驾神山赵匡胤屯营处。寺旁有神仙洞、白石泉、龙文石刻、柴王碑、柴王井、神山石塔(现仅存巨石塔基)等古迹。

山上古木参天，路转峰回，清泉涓涓，萦绕寺前。寺系唐大历年间建，历代均有修葺。寺旁有神仙洞，传闻有一道士居于洞中，以白石为餐。唐滁州刺史、诗人韦应物《寄全椒山中道士》诗，"今朝郡斋冷，忽念山中客。涧底束荆薪，归来煮白石。欲持一瓢酒，远慰风雨夕。落叶满空山，何处寻行迹？"因而神山寺名闻久远。

神山项目是全椒县2009年重点招商引资项目，该项目位于滁州市全椒县境内的神山国家森林公园范围内，距离瓦山林场仅15公里。建设内容包括综合服务区、山地度假区、酒店接待区、休闲农庄区、体育公园区、精品农业区等，建设规模达2万余亩，总投资10亿元。兼具旅游观光、休闲娱乐、山地度假、健身养生等多种功能的综合型、高品质的国家5A级旅游度假区。